L'histoire raconte la vie de 12 mignonnes petites soeurs : Karen, Sakuya, Hinako, Marie, Chikage, Yotsuba, Haruka, Rinrin, Mamoru, Aria, Kaho et Shirayuki. Le frère aîné s'apelle Minakamio Wataru. Wataru est un étudiant qui a échoué aux examens d'entrée du lycée. Toutefois, il fut accepté à Star Gazers Hill West University grâce au piston. Cette école est située sur une île (Promise Island) et il rencontra deux étranges personnages sur un bateau. le premier s'appelle Yamada Tataru et l'autre Mami. Au moment où il voulut descendre du bateau, il tomba à l'eau mais il fut sauvé par Karen, l'une de ses petites soeurs.(il ignore d'ailleurs qu'il a une soeur!). C'est à partir de là que tout commence...