Manji, jeune Samourai d'une trentaine d'années, ne se doute pas encore du destin qui l'attend, un destin hors du commun, qui le fera voyager à travers l'archipel Nippon.
Au court de sa courte vie, Manji, Samourai aux capacités martiales approximatives, sert son seigneur depuis déjà quelques années.
Un jour, celui-ci découvre une machination engendrée par son maître lui-même, afin de détourner des fonds et de corrompre certains pomtes du gouvernement d'Edo (à l'époque, capitale du Japon).

Il se rebelle alors, en allant à l'encontre de son serment de servitude, et va jusqu'à tuer son propre maître.
En faisant ce geste, il s'est non seulement condamné à mort, mais à également détruit tout ce en quoi il croyait.
Pourchassé par les Samourais restés fidèles, et épuisé par les combats, il se réfugie, tel une bête traquée, sachant que sa dernière heure est venue.
Découvert dans sa cache, il tente le tout pour le tout, et utilise ses dernières forces. Seulement, il ignorait que l'homme, auquel il venait de porter un coup fatal, n'était autre que le mari de sa soeur, qui assistera, impuissante, à l'exécution de l'homme qu'elle aime.
Manji survivra...