Ghost Recon place le joueur à la tête d'une escouade militaire fictive de nouvelle génération : la Compagnie D, 1er Bataillon, 5e unité des U.S. Special Forces, établie à Fort Bragg, en Caroline du Nord. À l'exception de la désignation « 5e unité SF », cette escouade est entièrement fictive. Ils sont surnommés « Les Ghosts ». Leur rôle n'est pas si différent des autres Forces spéciales, si ce n'est que leurs opérations demeurent hautement secrètes.

Les Ghosts sont organisés en trois équipes, nommées selon l'alphabet phonétique de l'OTAN : Alpha, Bravo et Charlie ; ce qui permet de distribuer deux soldats par équipe. Cependant, le joueur ne pouvant assigner plus de six soldats par mission (en mode Solo), il est libre d'élaborer deux équipes de trois soldats. Le joueur doit établir une stratégie de combat basée sur l'environnement du terrain d'opérations (village, base militaire, marais, etc.), et peut transmettre des instructions de mouvements et des règles d'engagement pour chacune des équipes, à l'aide d'une carte de commandement. Nous pouvons remarquer que les versions Xbox et PS2 n'intègrent pas d'équipe Charlie.
Sortie le 22 Novembre 2001 sur PC.