Dans son voyage pour devenir maître Pokémon, le héros rencontre d'autres dresseurs de Pokémon avec qui il se lie d'amitié. Dans son concept initial, le créateur du jeu basa les combats de Pokémon sur les compétitions d'insectes, plutôt que sur les violents combats de coqs auquel le jeu est aujourd'hui souvent comparé.