L'histoire de Gen 13 a lieu dans l'univers Wildstorm et croise parfois les aventures d'autres bédés de Lee, comme Wildcats et Team 7 (en fait, chacun des personnages principaux de Gen 13 est l'enfant d'un membre de la Team 7). La série bénéficiait d'un graphisme éclatant, attirant rapidement l'attention de lecteurs qui devinrent vite fidèles.

Les adolescents devaient à l'origine simplement participer à un projet gouvernemental, mais ils apprirent que ce projet couvrait des tests génétiques dans un environnement quasi-carcéral. C'est après avoir manifesté leurs pouvoirs surhumains qu'ils s'évadent et se retrouvent recherchés comme des dangereux criminels. Leur seul espoir est de parvenir à joindre leurs forces pour combattre leurs ennemis et découvrir leurs liens avec la Team 7.